Тема курсовой работы  для 1- 2 студентов 1- 4 курсов ФББ МГУ        
                                            
Тьютор профессор/зав. лабораторией Любецкий Василий Александрович 

Институт проблем передачи информации РАН.
                                                                                                                                                                   
куратор из НИИ ФХБ или ФББ  внс В.В. Алешин.
как связаться: e-mail lyubetsk@iitp.ru, lyubetsk@mail.ru                                                                                                                                             		тел. 8-9104646917.
                                                                                                                                                                              .                         Тема работы: Модель эволюции регуляторного сигнала

Характер работы (уточните; например: бионженерия; культуры клеток; анализ генома человека; программирование) 
‮ экспериментальная нет
‮ биоинформатика  в основном
‮ литературный отчасти обзор
Аннотация,  литература для введения в проблематику   
Эволюция белковых семейств и видов широко изучается, здесь разработаны многочисленные программные средства, построены деревья видов и деревья белков, реконструированы эволюционные события молекулярного уровня. Эта более традиционная тематика разрабатывается в нашей лаборатории и здесь можно продолжить исследования. Напротив, эволюция регуляторных сигналов практически не изучалась до сих пор. Нами разработана модель эволюции регуляторного сигнала, которая компьютерно реализована. Модель тестировалась на ряде сигналов (например, для сайтов связывания белков-регуляторов NrdR, MntR и LacI-семейства). Задача в том, чтобы тестировать модель на других сигналах, для этого собирая данные из литературы и баз данных по белковому семейству фактора транскрипции и по сайтам связывания белка-регулятора и внося уточнения в модель и компьютерную программу. Работа может относиться только к отдельным частям этого проекта, например, включать программирование или не включать его, ограничиваясь работой с уже готовой компьютерной программой. 
V. Lyubetsky, K. Gorbunov, L. Rusin, V. V’yugin, Algorithms to reconstruct evolutionary events at molecular level and infer species phylogeny. An article in the book: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. Springer Science & Business Media, Inc. 2005, p. 189-204.
Другие публикации в печати и пока будут доступны в рукописи.